Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA2P51531 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms