Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCNN1GP51170 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms