Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NESP48681 AC008993.3-201ENST00000633603 631 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NESP48681 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NESP48681 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NESP48681 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NESP48681 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NESP48681 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NESP48681 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NESP48681 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NESP48681 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NESP48681 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NESP48681 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NESP48681 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NESP48681 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NESP48681 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NESP48681 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NESP48681 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NESP48681 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NESP48681 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NESP48681 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NESP48681 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NESP48681 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NESP48681 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NESP48681 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NESP48681 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NESP48681 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NESP48681 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NESP48681 KLK8-203ENST00000347619 555 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NESP48681 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NESP48681 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NESP48681 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NESP48681 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NESP48681 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NESP48681 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NESP48681 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NESP48681 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NESP48681 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NESP48681 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NESP48681 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NESP48681 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NESP48681 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NESP48681 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NESP48681 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NESP48681 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NESP48681 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NESP48681 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NESP48681 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NESP48681 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NESP48681 CRCT1-201ENST00000368790 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NESP48681 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NESP48681 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NESP48681 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NESP48681 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NESP48681 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NESP48681 AC025419.1-201ENST00000537250 690 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NESP48681 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NESP48681 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NESP48681 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NESP48681 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NESP48681 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NESP48681 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NESP48681 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NESP48681 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NESP48681 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NESP48681 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NESP48681 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NESP48681 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NESP48681 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NESP48681 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NESP48681 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NESP48681 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NESP48681 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NESP48681 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NESP48681 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NESP48681 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NESP48681 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NESP48681 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NESP48681 CDIPT-AS1-203ENST00000638164 713 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NESP48681 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NESP48681 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NESP48681 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NESP48681 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NESP48681 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NESP48681 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NESP48681 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NESP48681 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NESP48681 CPA1-207ENST00000484324 1303 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NESP48681 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NESP48681 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NESP48681 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NESP48681 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NESP48681 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NESP48681 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NESP48681 HNRNPA1P72-201ENST00000529511 967 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NESP48681 AC009812.1-201ENST00000605948 1059 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NESP48681 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NESP48681 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NESP48681 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NESP48681 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NESP48681 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms