Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PIP4K2AP48426 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms