Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms