Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms