Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms