Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms