Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA13P31271 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms