Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCAP28676 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCAP28676 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCAP28676 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCAP28676 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCAP28676 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCAP28676 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCAP28676 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCAP28676 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCAP28676 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GCAP28676 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCAP28676 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCAP28676 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCAP28676 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCAP28676 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCAP28676 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCAP28676 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCAP28676 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCAP28676 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCAP28676 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCAP28676 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCAP28676 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCAP28676 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GCAP28676 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GCAP28676 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GCAP28676 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GCAP28676 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
GCAP28676 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GCAP28676 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GCAP28676 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GCAP28676 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GCAP28676 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GCAP28676 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GCAP28676 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GCAP28676 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GCAP28676 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GCAP28676 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GCAP28676 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms