Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCHP24723 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCHP24723 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCHP24723 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCHP24723 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCHP24723 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCHP24723 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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