Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF1P21675 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF1P21675 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF1P21675 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF1P21675 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF1P21675 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF1P21675 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF1P21675 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF1P21675 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF1P21675 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF1P21675 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF1P21675 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF1P21675 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF1P21675 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF1P21675 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF1P21675 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF1P21675 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF1P21675 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF1P21675 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF1P21675 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF1P21675 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms