Protein–RNA interactions for Protein: P21291

CSRP1, Cysteine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1P21291 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CSRP1P21291 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSRP1P21291 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSRP1P21291 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSRP1P21291 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSRP1P21291 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSRP1P21291 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSRP1P21291 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSRP1P21291 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSRP1P21291 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSRP1P21291 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSRP1P21291 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSRP1P21291 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSRP1P21291 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSRP1P21291 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSRP1P21291 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSRP1P21291 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSRP1P21291 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSRP1P21291 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSRP1P21291 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSRP1P21291 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CSRP1P21291 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms