Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms