Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GJA1P17302 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GJA1P17302 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJA1P17302 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA1P17302 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA1P17302 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA1P17302 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GJA1P17302 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA1P17302 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA1P17302 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GJA1P17302 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GJA1P17302 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms