Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA4P13612 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms