Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms