Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SMIM10L1-201ENST00000622602 4795 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 DOCK3-201ENST00000266037 8755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 STX16-202ENST00000355957 4897 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms