Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPBP07199 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPBP07199 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPBP07199 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPBP07199 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPBP07199 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPBP07199 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPBP07199 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPBP07199 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPBP07199 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPBP07199 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPBP07199 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPBP07199 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPBP07199 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPBP07199 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPBP07199 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPBP07199 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPBP07199 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPBP07199 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBP07199 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPBP07199 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPBP07199 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPBP07199 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms