Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRM2P04554 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRM2P04554 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRM2P04554 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRM2P04554 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRM2P04554 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRM2P04554 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRM2P04554 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRM2P04554 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRM2P04554 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRM2P04554 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRM2P04554 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRM2P04554 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRM2P04554 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PRM2P04554 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRM2P04554 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRM2P04554 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRM2P04554 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRM2P04554 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRM2P04554 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRM2P04554 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRM2P04554 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRM2P04554 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRM2P04554 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRM2P04554 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRM2P04554 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRM2P04554 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRM2P04554 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRM2P04554 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRM2P04554 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRM2P04554 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRM2P04554 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRM2P04554 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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