Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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