Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
B4DXG7 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
B4DXG7 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
B4DXG7 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
B4DXG7 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
B4DXG7 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
B4DXG7 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
B4DXG7 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
B4DXG7 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
B4DXG7 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
B4DXG7 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
B4DXG7 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
B4DXG7 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
B4DXG7 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
B4DXG7 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
B4DXG7 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
B4DXG7 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
B4DXG7 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
B4DXG7 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
B4DXG7 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms