Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms