Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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ARL2-SNX15V9GYD0 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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ARL2-SNX15V9GYD0 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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ARL2-SNX15V9GYD0 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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ARL2-SNX15V9GYD0 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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ARL2-SNX15V9GYD0 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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ARL2-SNX15V9GYD0 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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ARL2-SNX15V9GYD0 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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ARL2-SNX15V9GYD0 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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ARL2-SNX15V9GYD0 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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ARL2-SNX15V9GYD0 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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ARL2-SNX15V9GYD0 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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