Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms