Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REXO2Q9Y3B8 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms