Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms