Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNTNAP2Q9UHC6 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNTNAP2Q9UHC6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNTNAP2Q9UHC6 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms