Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms