Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CNTN3Q9P232 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CNTN3Q9P232 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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CNTN3Q9P232 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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CNTN3Q9P232 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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CNTN3Q9P232 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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CNTN3Q9P232 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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