Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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TBCCD1Q9NVR7 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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