Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVN2

RUSC1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1Q9BVN2 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUSC1Q9BVN2 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms