Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 LONRF2-201ENST00000393437 13912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 WIPF1-204ENST00000392547 4587 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 TMCC2-208ENST00000545499 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 DYNC1I1-204ENST00000437599 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 KLHL23-202ENST00000392647 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 PML-207ENST00000435786 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 UGGT2-203ENST00000376747 4832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 HAUS5-201ENST00000203166 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 CACNA2D3-AS1-201ENST00000471265 2078 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 IGSF9-202ENST00000368094 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 NCAM1-225ENST00000618266 5937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 GRIK1-206ENST00000399913 3234 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 NDRG4-204ENST00000394282 3626 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 SLC4A5-204ENST00000377634 3814 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 AC002550.1-201ENST00000565916 1379 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 AC020912.1-201ENST00000638312 5059 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 ELMOD3-202ENST00000393852 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 LPGAT1-202ENST00000366997 7782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 PCDHA10-202ENST00000506939 3788 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 ACSL6-207ENST00000379264 6539 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 TPO-204ENST00000382198 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 ATG13-211ENST00000528494 2351 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 ACVRL1-206ENST00000550683 4121 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 MUC20-205ENST00000447234 2589 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 SCN5A-209ENST00000451551 8343 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 AQP7-205ENST00000379507 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 TRIOBP-204ENST00000406386 10129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 FUT8-204ENST00000394586 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 DOCK3-201ENST00000266037 8755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 CLINT1-206ENST00000523094 3987 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP8Q9BV40 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP8Q9BV40 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP8Q9BV40 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP8Q9BV40 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP8Q9BV40 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP8Q9BV40 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP8Q9BV40 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP8Q9BV40 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP8Q9BV40 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP8Q9BV40 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP8Q9BV40 TMEM200A-201ENST00000296978 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP8Q9BV40 C2orf69-201ENST00000319974 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP8Q9BV40 RNF10-201ENST00000325954 3825 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP8Q9BV40 TUBGCP2-201ENST00000252936 3885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP8Q9BV40 SHOX-203ENST00000381578 3757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP8Q9BV40 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP8Q9BV40 CASP7-201ENST00000345633 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP8Q9BV40 IGHG2-202ENST00000641095 2594 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP8Q9BV40 DLG5-201ENST00000372391 7415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP8Q9BV40 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP8Q9BV40 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP8Q9BV40 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP8Q9BV40 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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