Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms