Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms