Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms