Protein–RNA interactions for Protein: Q93052

LPP, Lipoma-preferred partner, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPPQ93052 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LPPQ93052 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LPPQ93052 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPPQ93052 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPPQ93052 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPPQ93052 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPPQ93052 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms