Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 MADD-210ENST00000407859 5744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 CDH1-212ENST00000611625 4878 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 POLR2J4-202ENST00000427076 6466 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 LAMA4-201ENST00000230538 6547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 UBASH3B-201ENST00000284273 6912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 KCNB1-201ENST00000371741 11879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 ESPL1-201ENST00000257934 6623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 BIVM-ERCC5-204ENST00000639132 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 MECP2-201ENST00000303391 10505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 DNMBP-201ENST00000324109 6400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 GRIK3-201ENST00000373091 9101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 TMEM164-202ENST00000372068 5566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 GPR37L1-201ENST00000367282 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
COPS9Q8WXC6 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms