Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms