Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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TRAPPC6BQ86SZ2 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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TRAPPC6BQ86SZ2 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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TRAPPC6BQ86SZ2 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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TRAPPC6BQ86SZ2 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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TRAPPC6BQ86SZ2 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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TRAPPC6BQ86SZ2 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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