Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CATSPER4Q7RTX7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms