Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms