Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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