Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms