Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 TEAD1-207ENST00000638666 1281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 BNIP1-202ENST00000351486 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 MB-204ENST00000401702 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 SERPINB8P1-201ENST00000401898 377 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AL031058.1-201ENST00000561592 888 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AC245369.3-201ENST00000624687 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 C12orf45-201ENST00000280749 459 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AC010163.1-201ENST00000434440 520 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 CSTF3-203ENST00000438862 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AL357137.1-201ENST00000604645 203 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AC108002.3-201ENST00000612629 503 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 MIR4726-201ENST00000615971 58 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AC089987.2-201ENST00000328207 936 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 MIR345-201ENST00000362114 98 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AC123595.2-201ENST00000607854 549 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 KIR2DL4-203ENST00000357494 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AC131097.4-201ENST00000442867 571 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AP003062.1-201ENST00000528497 762 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AC064862.6-203ENST00000605139 691 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 PHBP3-201ENST00000412562 819 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 SWI5-204ENST00000419867 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AC106017.1-201ENST00000428348 440 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AC007952.3-201ENST00000442355 440 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AC007952.8-202ENST00000495691 440 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 FAM90A27P-201ENST00000593323 1370 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 FAM90A28P-202ENST00000597191 1374 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 CHCHD7-218ENST00000523975 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AC017081.1-201ENST00000420063 823 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 RN7SL76P-201ENST00000482435 289 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 MYLK-AS1-203ENST00000485162 587 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AC069503.1-201ENST00000538710 816 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 AC245884.8-201ENST00000599382 880 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP350Q5VT06 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms