Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 CNKSR2-207ENST00000543067 4355 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms