Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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