Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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SSX1Q16384 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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SSX1Q16384 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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SSX1Q16384 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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SSX1Q16384 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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SSX1Q16384 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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SSX1Q16384 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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SSX1Q16384 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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SSX1Q16384 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
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