Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ERI1-209ENST00000523898 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ZNF75D-202ENST00000370766 5592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 EXOC5-202ENST00000413566 8513 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 PDE7B-201ENST00000308191 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 BCL2L13-202ENST00000337612 4905 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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