Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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DDX39BQ13838 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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DDX39BQ13838 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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DDX39BQ13838 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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